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显微取精是微创手术。尽管睾丸显微取精有一定危害，但相较其他取精手术而言，显微取精的精子获得率高，并发症少，对患者的心理影响也较小。因此，睾丸显微取精术已成为非梗阻性无精症患者有效、安全也是必须的一种治疗手段。
显微取精手术的危害
双侧隐睾显微取精有一定的危害，可能影响睾丸分泌雄激素的功能，少数情况下还可能造成术后出血。另外，取精失败还会对患者的心理健康造成一定影响:
1、影响内分泌
显微取精需要切开睾丸，在镜下挑选出活动的精子或功能较好的生精小管，然后剪取生精小管、收集精子。在这一过程中，会不可避免地损伤睾丸间质组织，进而影响睾丸的分泌功能，使雄激素水平下降。不过由于显微技术的精确定位，损伤程度很轻，术后半年内绝大多数患者的雄激素水平可恢复到术前的90％以上，并不会对患者的性功能造成明显损害。
2、造成术后出血
显微取精手术是在显微镜下进行的微创手术，对睾丸和血管的损伤非常小，术后发生出血的风险甚至低于睾丸穿刺。极少数情况下，手术会损伤血管，导致切口出血、阴囊血肿等并发症，一般通过使用止血药物，促进机体吸收血肿即可改善，不会对机体造成长期影响。
3、影响心理健康
显微取精是有可能失败的，取精失败会导致患者负面情绪发生，引起焦虑、抑郁等，并影响患者家庭生活。针对这种情况，医生应在术前与患者进行充分沟通，提前告知手术可能出现的风险和失败，术后关注患者心理变化，及时安抚患者情绪，必要时可进行心理治疗。
