关于【核酸染料】,核酸染料弄到手上会怎么样,今天八宝盒小编给您分享一下,如果对您有所帮助别忘了关注本站哦。
内容导航:1、核酸染料2、核酸染料1、核酸染料核酸染料核酸染料在配置琼脂糖凝胶时融化至60℃时加入,一般是百分之一,比如称0.15克琼脂糖,加15毫升TAE,一般多一点。加入2ul的核酸染料。核酸染料的作用是和链结合,可以帮助成像,方便我们在凝胶成像设备下观看条带。
倒琼脂糖凝胶时,注意看看卡槽,方向,不要有气泡。
核酸染料(Nucleic acid dye)DNA染料:碘化丙啶(PI)、DAPI
核酸染料加热会失效吗不会失效。常用的核酸染料有:
1、EB(溴化乙锭)是高度灵敏的嵌入性芳香族荧光化合物,为强致癌诱变剂,但价格便宜,用于观察琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶中的核酸。
2、GoldView I型/II型染料是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,也可用于RNA染色。
3、GelRed和GelGreen属于大分子产品,经过埃姆斯 AMS 和相关测试,结果表明,该染料的诱变性远小于溴化乙锭(EB),是两种集高灵敏、低毒性和超稳定于一身的极佳的荧光核酸凝胶染色试剂。
4、SYBR Green 和SYBR Gold于1995 年由 Molecular probes 公司推出,是一种高灵敏的核酸染料,稳定性差。
2、核酸染料EB(溴化乙锭)
是高度灵敏的嵌入性芳香族荧光化合物,为强致癌诱变剂,但价格便宜,用于观察琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶中的核酸。通常用于分子遗传学、DNA和染色质结构分析等研究中,特别是国内很多实验室仍在使用EB进行凝胶核酸电泳实验的染色。它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性,在高离子强度的饱和溶液中,大约每2.5个碱基插入一个溴化乙锭分子。EB的这种特性使其成为一种核酸染料,常用于琼脂糖凝胶电泳中的核酸染色。溴化乙锭在紫外区302nm和366nm处有吸收峰,在紫外光的照射下,溴化乙锭可被激发出橙红色的荧光(590nm)。结合有DNA的溴化乙锭复合物的荧光强度要比没有结合DNA的染料高出20-30倍,因此溴化乙锭可检测到少至10ng的DNA条带,非常灵敏。
原理:EB是极易渗透细胞膜与胞内DNA嵌合的小分子,它具有平面共轭大环结构,这种扁平分子可以嵌入核酸双链的配对的碱基之间,是典型的DNA分子插入试剂,菲啶环插入到DNA分子的碱基对之间,与DNA嵌合形成稳定的复合物,并影响DNA的复制,破坏正常的遗传生理现象。在紫外线激发下, 未与核酸结合的溴化乙锭可被激发出橙红色荧光。在与DNA或双链 RNA结合时,荧光强度会增强20倍,使 得核酸电泳后的胶片可以辨识核酸的相对位置。在核酸分子中, EB分子插入到两层碱基对之间,发出红色荧光。在凝胶中加入终浓度为 0.5 μg/ml 的 EB,可以在电泳过程中随时观察核酸的迁移情况,这种方法适用于一般性的核酸检测。
注意:EB作为诱变性的化合物,它在人体中诱导突变的机制是不可逆转的,如果你只是手接触了用 EB污染的东西 , 用肥皂水洗一下就没事了。一定要带手套操作有 EB 污染的实验。 EB有很强的诱变剂,可引起碱基错配诱发癌变,操作时一定要慎重。
2. GoldView I型/II型染料
GoldView(GV)是一种可代替溴化乙锭(EB)的新型核酸染料,其灵敏度与EB相当,使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光,也可用于RNA染色。
实质上,所谓的Goldview就是吖啶橙,也就是传说中的AO,[补充一下:吖啶橙( acridine orange, AO)是最经典的极灵敏的荧光染料,它可对细胞中的DNA 和 RNA 同时染色而显示不同颜色的荧光。 其激发峰为 492nm,荧光发射峰为 530nm(DNA )、640nm(RNA ),它与双链 DNA 的结合方式是嵌入双链之间,而与单链 DNA 和 RNA 则由静电吸引堆积在其磷酸根上。在蓝光(502nm)激发下,细胞核发亮绿色荧光(约530nm),核仁和胞质 RNA 发橘红色荧光( >580nm)。吖啶橙的阳离子也可以结合在蛋白质、多糖和膜上而发荧光,但细胞固定阻抑了这种结合,从而主要显DNA、RNA 两种核酸 ]。有一种传统的细胞凋亡试验,采用的染料正是吖啶橙,也就是AO/EB染色试验,EB无法穿透完整的细胞膜,而AO可以穿过细胞膜染上细胞核,以此来区分凋亡和未凋亡的细胞。
缺点:Goldview对于大片段DNA的染色效果良好,但是在对于500bp以下的片段效果不是很好,还有一个很致命的弱点是它的荧光基团在紫外灯下非常容易淬灭,一般5-10min条带就会消失。另外Goldview不适用于胶回收。且荧光效果远不如EB,灵敏度差,本底色严重,不利用于回收,不稳定,在紫外灯下其诱导突变能力极高。
注意:GoldView是一种剧毒产品,实验是一定要带好防护手套。
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